Після битви при Джакку Ембо отримав фінансування від Нової Республіки, але коли воно закінчилося, він жив як фермер на Фелюції.
Після битви при Джакку, Ембо вижив би і зрештою приєднатися до команди мисливців за головами Джаса Емарі. Він отримав би повне прощення за свої дії.
Після виходу на пенсію, він служив у резерві і його призначали лише за потреби наприкінці Війн клонів, таким чином ставши ветераном-офіцером-клонами. Він замінив командира Фокса на посаді головного офіцера елітної гвардії Корусанта.
Завдяки своїм біочіпам, які модифікували поведінку, солдати-клони Кенобі звернулися проти свого генерала-джедая та застрелили його у воронку. Однак Кенобі вижив і втік з Утапау. Після закінчення Війн клонів, Галактична Імперія окупувала планету, що призвело до того, що багато біженців Пау'ан покинули Утапау.
Після напруженої битви звір врешті-решт був збиті газовими бомбами, вбиті великими дозами потужного токсину (той самий, що змусив його знищити Корусант).
З важко пораненою правою рукою Сугі та інші допомогли Ембо потрапити в головний амбар у центрі села, оскільки він не міг більше брати участь у битві. Після того, як Онака та його пірати відступили та покинули систему, Ембо залишив корабель Сугі, Хало, разом із джедаями та відправився до форпосту Республіки.