Що таке Entrez в біоінформатиці?

вступ. Entrez — це система баз даних молекулярної біології, яка надає інтегрований доступ до даних послідовності нуклеотидів і білків, інформації про геноцентричне та геномне картування, даних 3D-структури, PubMed MEDLINE тощо.

Entrez Gene — це спеціальна база даних генів Національного центру біотехнологічної інформації (NCBI)., підрозділ Національної медичної бібліотеки (NLM), розташований на території кампусу Національного інституту здоров’я США (NIH) у Бетесді, штат Меріленд, США.

Entrez Direct (EDirect) забезпечує доступ до набору взаємопов'язаних баз даних NCBI з вікна терміналу Unix. Терміни пошуку вводяться як аргументи командного рядка. Окремі операції пов'язані з Unix-каналами для створення багатокрокових запитів. Потім вибрані записи можна отримати в різних форматах.

Пакет Entrez

  1. Почніть із локального файлу, що містить список інвентарних номерів або ідентифікаторів.
  2. Виберіть базу даних, яка відповідає типу інвентарних номерів або ідентифікаторів у вашому вхідному файлі.
  3. Використовуйте «Огляд» або «Виберіть файл»… …
  4. Натисніть кнопку Отримати, щоб переглянути список підсумків документів.

Entrez шукає нуклеотиди, білки та бази даних літератури та посилає відповідні записи. SRS — це пошуковий інтерфейс для понад 80 біологічних баз даних EBI. DBGET/LinkDB інтегрує пошук у базі даних із такими інструментами, як BLAST у GenomeNet у Японії.

Entrez — це система баз даних молекулярної біології, яка надає інтегрований доступ до даних послідовності нуклеотидів і білків, інформації про геномне та геномне картування, даних 3D-структури, PubMed MEDLINE тощо.

Related Post

Який документальний фільм про 9 російських туристів?Який документальний фільм про 9 російських туристів?

Конспект. Невідома переконлива сила режисер Ліам Ле Гійо досліджує інформацію та теорії навколо Інцидент на перевалі Дятлова Інцидент на перевалі Дятлова Інцидент на перевалі Дятлова (рос. гибель тургруппы Дятлова, лат.

Яке значення має Червона книга?Яке значення має Червона книга?

Юнг стверджував, що досвід, описаний у Червоній книзі, був основи відмінних теорій його аналітичної психології, кажучи: «Усі мої роботи, вся моя творча діяльність виникла з тих початкових фантазій і мрій,

Якої національності даяк?Якої національності даяк?

Даяк – це загальний термін, який використовується для класифікації досить великої групи корінне населення острова Борнео. Фактично острів поділений між трьома країнами: Індонезією, Малайзійськими Федеративними Штатами Сабах і Саравак і