Прогнозування вторинної структури білка забезпечує важливий перший крок до прогнозування третинної структури, а також пропонує інформацію про активність білків, взаємозв’язки та функції. Вторинна структура білка відноситься до поліпептидного остова локальних конформаційних білків. 29 червня 2018 р.
Передбачення структури білка є дисципліна передбачення структури білка за його послідовністю. З: Trends in Biochemical Sciences, 2018.
Вторинна структура формально визначається структура водневих зв'язків між аміногідрогеном і карбоксильними атомами кисню в скелі пептиду.
Вторинна структура (2˚) — Альфа-спіралі. У той час як первинна структура описує послідовність амінокислот, що утворюють пептидний ланцюг, вторинна структура відноситься до локальне розташування ланцюга в просторі. У білках було ідентифіковано декілька загальних вторинних структур.
Набір даних. Використовується набір даних Набір даних CullPDB, що складається з 6133 білків, кожен з 39900 ознаками. 6133 білки × 39900 ознак можна переформувати в 6133 білки × 700 амінокислот × 57 ознак. Амінокислотні ланцюги описуються матрицею 700 × 57, щоб розмір даних був узгодженим.
Прогноз вторинної структури є набір методів у біоінформатиці, які спрямовані на прогнозування локальних вторинних структур білків лише на основі знання їх амінокислотної послідовності.