Конструкція TaqMan Зонди TaqMan повинні бути розроблені (якщо можливо) з a
45-65%, висока складність, відсутність димеру з праймерами, висока Tm (60-65°C) і довжина зонда 18 до 30 bp і Tm зонда повинна бути на 8-10°C вище ніж праймери.
Зонди TaqMan® складаються з a 18-22 п.н олігонуклеотидний зонд, який мічений репортерним флуорофором на 5'-кінці та гасильним флуорофором на 3'-кінці.
Амплікони з 50–150 пар основ рекомендовано для ефективного підсилення. Амплікон також повинен охоплювати принаймні одну некодуючу послідовність (інтрон), щоб запобігти ампліфікації цільового гена в геномній ДНК.
В ідеалі розмір амплікону qPCR коливається від Від 75 до 200 б у довжину, якщо обмеження конструкції не виводять праймерів за межі цього діапазону. Насправді розмір фрагмента можна визначити з урахуванням кількох факторів, включаючи біологію, що розглядається.
З TaqMan Assays завжди гарантовано ефективність золотого стандарту. Аналіз Applied Biosystems TaqMan вже давно вважався золотий стандарт у кількісному геномному та протеомному аналізі, що забезпечує високу специфічність, відтворюваність, чутливість і неперевершений вміст.
Зонди TaqMan від 18 до 30 п.о. повинні бути розроблені (якщо це можливо) з вмістом GC 45-65%, високою складністю, без димеру з праймерами, високою Tm (60-65°C) і довжиною зонда 18 до 30 bp і Tm зонда повинна бути на 8-10°C вище ніж праймери.