Використовується 3' –> 5' екзонуклеазна активність щоб видалити непарну основу на 3' кінці зростаючого пасма (це називається функцією "вичитки"); це необхідно, тому що якщо 3'-нуклеотид не має пари основ з ланцюгом матриці, він не є місцем для подовження ланцюга.
3´ – 5´ екзонуклеазна активність, коректурна активність AKA, розщеплює нуклеотиди з 3´ гідроксильними групами в напрямку 3´ до 5´. Це включає в себе корекцію невідповідних пар основ і термінального 3´ травлення. Деякі полімерази мають один або обидва типи екзонуклеазної активності.
Отже, якщо мутація відбудеться в домені, який відповідає за активність екзонуклеази 3′→5′ схильна до помилок реплікація ДНК відбудеться. Активність екзонуклеази 5′→3′ є корисною для видалення праймерів, щоб відповідні нуклеотиди могли бути вставлені в відстаючий ланцюг.
Потреба в точності, ймовірно, пояснює, чому реплікація ДНК відбувається лише в напрямку 5'-3'. Якби була ДНК-полімераза, яка додала дезоксирибонуклеозидтрифосфати в напрямку 3'-5', зростаючий кінець 5'-ланцюга, а не вхідний мононуклеотид, буде нести активуючий трифосфат.
Притаманна 5'-3' екзонуклеазна активність Taq означає, що ПЛР-ампліфікація може бути досягнута одночасно з вивільненням сигналу від мішень-специфічного флуорогенного зонда. 5'-3' екзонуклеазна активність Taq розщеплює 5'-кінець гібридизованого олігозонда для вивільнення як моно-, так і олігонуклеотидів.
Активність екзонуклеази 3' –> 5' використовується для видаліть непарну основу на 3' кінці зростаючого пасма (це називається функцією "вичитки"); це необхідно, тому що якщо 3'-нуклеотид не має пари основ з ланцюгом матриці, він не є місцем для подовження ланцюга.