Верхня межа маси для MALDI становить приблизно 350 000 Да. MALDI корисний для сумішей, таких як триптичні гідролізи, оскільки ця техніка виробляє переважно (M+H)+ видів для низькомолекулярних сполук.
The нездатність розрізняти споріднені види може бути наслідком внутрішньої подібності самих організмів. Наприклад, MALDI-TOF MS наразі не може відрізнити E. coli від Shigella. Ймовірно, це може бути не два види, а один, як припускають систематики46.
MALDI-MS може виявляти широкий спектр біомолекул, починаючи від від малих (m/z < 1000) [6] до великих молекул (m/z > 100 кДа) [7].
Зразок із типовою концентрацією 5–100 мкМ мінімальний об’єм – 2 мкл. Загальна кількість зразка, необхідного для аналізу MALDI, залежить від їх молекулярної маси. Для малої молекулярної маси (1000 або менше) мінімальна кількість, необхідна для аналізу, становить 16 пікомоль/мікролітр.
Мас-спектрометри MALDI зазвичай використовують лазери з відносно великими розмірами променя (діаметром близько 100 мкм) при аналізі стандартних сухокрапельних препаратів.
Верхня межа маси для MALDI становить приблизно 350 000 Да. MALDI корисний для таких сумішей, як триптичні гідролізи, оскільки ця техніка дає переважно види (M+H)+ для сполук з нижчою молекулярною масою.