Загальноприйнятим «правилом Кейла» є таке трипсин розщеплюється поряд з аргініном або лізином, але не раніше проліну.
Його функція полягає в тому для розщеплення білків на більш дрібні пептиди в дванадцятипалій кишці тонкої кишки. Він допомагає перетравлювати харчовий білок, розриваючи ланцюг амінокислот. Він також активує інші зимогени або проферменти, присутні в панкреатичному соку.
Оптимальними є температура і pH для продуктивності трипсину 37 °C і pH 7,8 (Олсен та ін., 2004). При 55 °C спостерігалося швидке зниження активності трипсину (Galvão, Silva, Custódio, Monti, & Giordano, 2001). При низькій температурі його денатурація відбувається повільно.
Специфічність розщеплення трипсину: Трипсин переважно розщеплюється за Arg або Lys у положенні P1. У статистичному дослідженні, проведеному Keil (1992), негативний вплив залишків, що оточують зв’язки Arg і Lys (тобто позиції P2 і P1' відповідно) під час розщеплення трипсину.
Перетравлення розчину Для розщеплення пептидів або білків співвідношення між 1:100 до 1:20 (мас./мас.) ферменту на субстрат рекомендується.
Інкубація клітин із надмірною концентрацією трипсину або довше, ніж потрібно викликають ушкодження та загибель клітин шляхом пошкодження клітинних мембран. Якщо ви не впевнені щодо концентрації трипсину, яку слід використовувати, почніть із найменшої очікуваної ефективної концентрації та збільшуйте, лише якщо клітини не відокремлюються.